Edaspidi kui küsimuse küsija vastu ei ole, siis ilmuvad küsitud küsimused koos vastustega ka siia!

Tere tarmees taskus, mul on probleem ühe evolutsioonibioloogia ülesandega. Paluks lahendust koos väikese seletusega, sest ma ei saa mitte midagi aru.

Ülesanne: Antud on 15 OTU fülogeneesipuu. A) Mis on selle puu koalestsentshinnang (rho), selle B) hajuvus ja standardhälve?




Vastus:

Väike seletus:
OTU - Operational Taxonomic Unit. Uurimise all olev taksonoomiline grupp.
Siin ülesandeks on OTUdeks need isendid. Number ringi sees märgib isendite arvu. Risti kriipsud joonisel märgivad mutatsioone ehk erinevuse tekkimist. Evolutsiooniliselt kõige vanem OTU on see 6 isendiga grupp, sest sinna on juurde märgitud, et ta on rajaja, teised OTUd on evolutsiooniliselt nooremad ja rajaja järeltulijad.

Lahendus:
A) Rho saamiseks tuleb mutatsioonide arv korrutada isendite arvuga, kellel see mutatsioon esineb, siis need kokku liita ja jagada kogu OTUde arvuga.

1*9 = 9
1*5 = 5
3*1 = 3
1*1 = 1
Summa: 18
Rho on siis 18/15 = 1,2
vastus A) Rho = 1,2 mutatsiooni

B) hajuvus saadakse samade tehetega, aga OTUde arvud tõstetakse ruutu.

1*81 = 81
1*25 = 25
3*1 = 3
1*1 = 1
summa:110
hajuvus on 110/225 = 0,49
standardhälve on ruutjuur hajuvusest, see on sqrt(0,49) = 0,70
Vastus B) Antud puu hajuvus on 0,49 ja standardhälve on 0,7 mutatsiooni.